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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
22/03/2010 |
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Data da última atualização: |
07/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAPROTKA, T.; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. N.; RESENDE, R. O.; JESKE, H.; FARIA, J. C.; RIBEIRO, S. G. |
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Afiliação: |
T. PAPROTKA, UNIVERSITY OF STUTTGART; LEONARDO SILVA BOITEUX, CNPH; MARIA ESTHER DE N FONSECA BOITEUX, CNPH; R. O. RESENDE, UNB; H. JESKE, UNIVERSITY OF STUTTGART; JOSIAS CORREA DE FARIA, CNPAF; SIMONE DA GRACA RIBEIRO, CENARGEN. |
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Título: |
Genomic diversity of sweet potato geminiviruses in a Brazilian germplasm bank. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Virus Research, Amsterdam, v. 149, n. 2, p. 224-233, May 2010. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Begomoviruses cause major diseases of sweet potato worldwide impairing considerably the yields of this important food staple. Since sweet potato plants are vegetatively propagated and globally transported, they are prone to accumulate and disseminate geminiviruses. Effective diagnostic tools are, therefore, desirable. We studied the genomic diversity of geminiviruses present in naturally-infected sweet potato accessions belonging to a Brazilian germplasm bank collection. Fifty-five samples from different sweet potato accessions displaying geminivirus-like symptoms were analyzed by combining rolling circle amplification (RCA) with restriction fragment length polymorphism (RFLP) and sequencing. The restriction enzyme MspI (HpaII) revealed diverse band patterns in 55 samples and digestion with BamHI, SstI or PstI resulted in full-length sweet potato geminivirus DNAs of about 3 kb in 46 samples. In addition, smaller fragments were identified as either viral ?Defective DNAs? (D-DNAs) or mitochondrial plasmid DNAs. The diversity of sweet potato-associated geminiviruses was found to be very high under Brazilian conditions. Representative viral full-length DNAs have been cloned and sequenced yielding two new tentative species, three strains and several variants of previously described sweet potato geminiviruses. Sequence comparisons identified footprints of recombination in their genomes underscoring the risk of generating new geminiviruses in vegetatively propagated germplasm bank material. The sites of recombination were found in conjunction with predicted hairpin structures. We propose diagnostic routines to screen germplasm bank material for geminiviruses by the rapid and reliable RCA/RFLP as the technique of choice. MenosBegomoviruses cause major diseases of sweet potato worldwide impairing considerably the yields of this important food staple. Since sweet potato plants are vegetatively propagated and globally transported, they are prone to accumulate and disseminate geminiviruses. Effective diagnostic tools are, therefore, desirable. We studied the genomic diversity of geminiviruses present in naturally-infected sweet potato accessions belonging to a Brazilian germplasm bank collection. Fifty-five samples from different sweet potato accessions displaying geminivirus-like symptoms were analyzed by combining rolling circle amplification (RCA) with restriction fragment length polymorphism (RFLP) and sequencing. The restriction enzyme MspI (HpaII) revealed diverse band patterns in 55 samples and digestion with BamHI, SstI or PstI resulted in full-length sweet potato geminivirus DNAs of about 3 kb in 46 samples. In addition, smaller fragments were identified as either viral ?Defective DNAs? (D-DNAs) or mitochondrial plasmid DNAs. The diversity of sweet potato-associated geminiviruses was found to be very high under Brazilian conditions. Representative viral full-length DNAs have been cloned and sequenced yielding two new tentative species, three strains and several variants of previously described sweet potato geminiviruses. Sequence comparisons identified footprints of recombination in their genomes underscoring the risk of generating new geminiviruses in vegetatively propagated germplasm bank ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Batata-doce; Diversidade genética; Geminivírus. |
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Thesagro: |
Banco de germoplasma; DNA; Ipomoea Batatas. |
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Thesaurus Nal: |
Begomovirus; Gene banks; Genetic variation; Restriction fragment length polymorphism; Sweet potatoes. |
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Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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520 $aBegomoviruses cause major diseases of sweet potato worldwide impairing considerably the yields of this important food staple. Since sweet potato plants are vegetatively propagated and globally transported, they are prone to accumulate and disseminate geminiviruses. Effective diagnostic tools are, therefore, desirable. We studied the genomic diversity of geminiviruses present in naturally-infected sweet potato accessions belonging to a Brazilian germplasm bank collection. Fifty-five samples from different sweet potato accessions displaying geminivirus-like symptoms were analyzed by combining rolling circle amplification (RCA) with restriction fragment length polymorphism (RFLP) and sequencing. The restriction enzyme MspI (HpaII) revealed diverse band patterns in 55 samples and digestion with BamHI, SstI or PstI resulted in full-length sweet potato geminivirus DNAs of about 3 kb in 46 samples. In addition, smaller fragments were identified as either viral ?Defective DNAs? (D-DNAs) or mitochondrial plasmid DNAs. The diversity of sweet potato-associated geminiviruses was found to be very high under Brazilian conditions. Representative viral full-length DNAs have been cloned and sequenced yielding two new tentative species, three strains and several variants of previously described sweet potato geminiviruses. Sequence comparisons identified footprints of recombination in their genomes underscoring the risk of generating new geminiviruses in vegetatively propagated germplasm bank material. The sites of recombination were found in conjunction with predicted hairpin structures. We propose diagnostic routines to screen germplasm bank material for geminiviruses by the rapid and reliable RCA/RFLP as the technique of choice.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| 61. |  | CARDOSO, C. F.; SILVEIRA, F. A. da; OLIVEIRA, G. M. de; CAVÉCHIA, L. A.; ALMEIDA, J. P. S.; SUJII, E. R.; FONTES, E.; PIRES, C. S. S. Principais polinizadores de Gossypium hirsutum var. latifolium (Malvaceae), cv. delta opal, em uma localidade do Distrito Federal, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. O algodão como oportunidade de negócios: resumos. Uberlândia: ABRAPA: AMIPA: Embrapa Algodão, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 62. | | CARSOS, C. F.; SILVEIRA, F. A. da; OLIVEIRA, G. M. de; CAVÉCHIA, L. A.; ALMEIDA, J. P. S.; SUJII, E. R.; FONTES, E.; PIRES, C. S. S. Principais polinizadores de Gossypium hirsutum var. latifolium (MALVACEAE), CV. Destaopa, em uma localidade do Distrito Federal, Brasil In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 63. | | SILVEIRA, F. G. F. da; SOUZA, L. da S.; OLIVEIRA, A. S. de; SOUZA, L. D.; PEREIRA, F. A. de C.; SILVA, F. T. dos S. Redistribuição da água e capacidade de campo em latossolo amarelo distrocoeso, em Cruz das Almas, Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas: anais. Uberlândia: SBCS; UFU; ICIAG, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 64. | | PIRES, C.; CARDOSO, C. F.; LIMA, M. A.; SILVEIRA, F. A.; CAMPOS, L. A. O.; BARROSO, P. A. V.; SUJII, E.; FONTES, E. Risk assessment of GM cotton to flower visitors in Brazil. In: ENCONTRO SOBRE ABELHAS, 8., 2008, Ribeirão Preto. Biodiversidade e uso sustentado de abelhas: anais. Ribeirão Preto: FUNPEC, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 65. | | VIANA, E. de S.; AMORIM, T. da S.; OLIVEIRA, L. A. de; REINHARDT, D. H. R. C.; SILVEIRA, F. G. F.; SANTANA, F. A.; SANTANA, P. N. Physicochemical characteristics of minimally processed 'Pérola' pineapples treated with edible coatings. Acta Horticulturae, Leuven, n. 822, p. 291-300, mar. 2009. Edição de Proceedings of the VI International Pineapple Symposium, João Pessoa, nov. 2007. Disponível também em CD-ROM e on-line.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 67. | | ASSIS, F. A.; DIAS, G. M. G.; PASQUAL, M.; SILVEIRA, F. A.; PIO, L. A. S.; CHAGAS, E. A.; MARTINS, A. D.; JANONI, F.; ASSIS, G. A. Silício na formação de calos e na quantificação de DNA de Eugenia Pyriformis (Myrtaceae). In: In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 20.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 7., 2015, Piracicaba. Floricultura contemporânea. Piracicaba: ESALQ, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 68. | | SILVEIRA, F. Q. de P.; ROCHA, H. G. C.; LIMA, M. F.; RESENDE, L. V.; AVILA, A. C. de; BEZERRA, I. C. A study of the diversity of whitefly-trnasmitted geminivirus in the Submedio of San Francisco Valley- Brazil using PCR. Fitopatologia Brasleira, Brasília, DF, v. 23, p. 312, ago. 1998. Suplemento. Edição dos Resumos do 31 Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Fortaleza, 1998.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 69. | | TETILA, E. C.; SILVEIRA, F. A. G. da; COSTA, A. B. da; AMORIM, W. P.; ASTOLFI, G.; PISTORI, H.; BARBEDO, J. G. A. YOLO performance analysis for real-time detection of soybean pests. Smart Agricultural Technology, v. 7, 100405, Mar. 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 70. | | PIRES, V. C.; BOTELHO, A. C.; GONÇALVES, G. C. P. C.; CHAGAS, P. B. C. das; SILVEIRA, F. A. da; SUJII, E. R.; FONTES, E.; PIRES, C. S. S. Abelhas polinizadoras de Gossypium barbadense (Malvaceae), no Distrito Federal - Brasil, e sua importância na análise de risco de fluxo gênico dos algodoeiros geneticamente modificados. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.291.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 71. | | PIRES, V. C.; SILVEIRA, F. A.; BOTELHO, A. C.; GONÇALVES, G. C. P. C.; CHAGAS, P. B. C.; SUJII, E. R.; FONTES, E. M. G.; PIRES, C. S. S. Abelhas visitantes florais de Gossypium barbadense (Malvaceae), no Distrito Federal, e sua importância na análise de risco de fluxo gênico dos algodoeiros geneticamente modificados no Brasil. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 31 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 243).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 73. | | SILVEIRA, J. R. S.; LIMA, V. P. de; SILVA, A. P. G. da; REIS FILHO, M. S. dos; MELO, L. F. F.; TAVARES, C. M. F. dos S.; SILVA, S. de O. e; SILVEIRA, F. G. F. da. Avaliação de cultivares de bananeiras no recôncavo sul da Bahia. In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 1413| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 74. | | MARANHÃO, T. D.; CÂNDIDO, M. J. D.; LOPES, M. N.; POMPEU, R. C. F. F.; CARNEIRO, M. S. de S.; FURTADO, R. N.; SILVA, R. R. da; SILVEIRA, F. G. A. da. Biomass components of Pennisetum purpureum cv. Roxo managed at different growth ages and seasons. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 19, n. 1, p. 11-22, jan./mar. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 75. | | PIRES, V. C. P.; SILVEIRA, F. A.; SUJII, E. R.; TOREZANI, K. R. S.; RODRIGUES, W. A.; ALBUQUERQUE, F. A. de; RODRIGUES, S. M. M.; SALOMAO, A. N.; PIRES, C. S. S. Importance of bee pollination for cotton production in conventional and organic farms in Brazil. Journal of Pollination Ecology, v. 13, p. 151-160, 2014| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 76. | | RODRIGUES, W. A.; PIRES, V. C.; TOREZANI, K. S.; SOUZA, S. L. de; SOUSA, A. A. T. C. de; RODRIGUES, S.; ALBUQUERQUE, F. A. de; SUJII, E. R.; SILVEIRA, F. A.; PIRES, C. S. S. Importância das abelhas para a produção dos algodoeiros no Brasil . In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 24., 2012, Curitiba. Anais... Curitiba: SBE, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 77. | | PIRES, C. S. S.; SILVEIRA, F. A.; CARDOSO, C. F.; SUJII, E. R.; PAULA, D. P.; FONTES, E. M. G.; SILVA, J. P. da; RODRIGUES, S. M. M.; ANDOW, D. A. Selection of bee species for environmental risk assessment of GM cotton in the brazilian Cerrado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 8, p. 573-586, ago. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 78. | | CARDOSO, C. F.; SILVEIRA, F. A; OLIVEIRA, G. M.; CAVÉCHIA, L. A.; ALMEIDA, J. P. S.; NAKASU, E. Y. T.; SUJII, E. R.; FONTES, E. M. G.; PIRES, C. S. S. Principais polinizadores de Gossypium hirsutum latifolium cv. delta opal (Malvaceae), em uma localidade do Distrito Federal, Brasil. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 212).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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